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課程名稱 |
育種試驗資料分析
DATA ANALYSIS FOR PLANT BREEDING EXPERIMENTS |
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開課學期 |
99-1 |
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授課對象 |
生物資源暨農學院 農藝學系 |
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授課教師 |
胡凱康 |
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課號 |
Agron5013 |
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課程識別碼 |
621 U5580 |
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班次 |
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學分 |
3 |
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全/半年 |
半年 |
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必/選修 |
選修 |
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上課時間 |
星期一7,8(14:20~16:20)星期五5(12:20~13:10) |
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上課地點 |
農藝304農藝304 |
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備註 |
總人數上限：20人 |
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Ceiba 課程網頁 |
http://ceiba.ntu.edu.tw/991Stat4BreedingExp |
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課程簡介影片 |
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核心能力關聯 |
核心能力與課程規劃關聯圖 |
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課程大綱
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為確保您我的權利,請尊重智慧財產權及不得非法影印
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課程概述 |
第一部分：多變數分析的應用
1）多變數資料分析的特性
2）一些常用的線性代數操作
3）多變數資料的圖形顯示
4）多變數資料差異顯著性分析
5）空間與距離的概念
6）主成分分析
7）因子分析
8）群聚分析
第二部分：定位數量性狀基因座
1) 連鎖與互換
2) 定位函數
3) 建立連鎖群圖譜
4) 數量性狀基因座效應估計
5) 單一標記分析
6) 區間定位法
7) 多重區間定位法 |
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課程目標 |
本課程的對象為農藝研究所碩士班以上，以作物育種為專業的同學。課程的內容為與育種有關的統計分析方法，隨著分子標記在育種上的使用日益普及，本學期課程中的主題亦分為以分子標記資料估計遺傳歧異度，與定位數量性狀基因座兩部分。 |
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課程要求 |
建議先修試驗設計及複因子試驗設計 |
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預期每週課後學習時數 |
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Office Hours |
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指定閱讀 |
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參考書目 |
B. F. J. Manly, 1994. Multivariate Statistical Methods: A Primer. 2nd Ed. Chapman & Hall. |
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評量方式
(僅供參考) |
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週次 |
日期 |
單元主題 |
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第1週 |
9/13,9/17 |
第1章 距離的概念 |
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第2週 |
9/20,9/24 |
第2章 以特徵根與特徵向量為基礎的空間描述 |
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第3週 |
9/27,10/01 |
第3章 主成分分析 |
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第4週 |
10/04,10/08 |
第4章 因子分析 |
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第5週 |
10/11,10/15 |
第5章 PCoA |
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第6週 |
10/18,10/22 |
第6章 有關距離的一些補充 |
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第7週 |
10/25,10/29 |
第7章 多變數的顯著性測驗 |
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第8週 |
11/01,11/05 |
第8章 集群分析 |
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第9週 |
11/08,11/12 |
第1章 連鎖與互換 |
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第10週 |
11/15,11/19 |
第2章 定位函數 |
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第11週 |
11/22,11/26 |
第3章 建立連鎖群圖譜 |
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第12週 |
11/29,12/03 |
第4章 數量性狀基因座效應估計 |
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第13週 |
12/06,12/10 |
第5章 單一標記分析 |
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第14週 |
12/13,12/17 |
第6章 區間定位法 |
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第15週 |
12/20,12/24 |
第7章 多重區間定位法 |
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第16週 |
12/27,12/31 |
第7章 多重區間定位法 |
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第17週 |
1/03,1/07 |
第7章 多重區間定位法 |
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